MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp17

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017417	TAA	2	6	608	613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
2	NC_017417	AAAT	2	8	681	688	75 %	25 %	0 %	0 %	387827840
3	NC_017417	CAA	2	6	691	696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
4	NC_017417	ATA	2	6	737	742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
5	NC_017417	ATA	2	6	770	775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
6	NC_017417	ACA	3	9	797	805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
7	NC_017417	GAT	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
8	NC_017417	GAA	2	6	841	846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
9	NC_017417	AAAG	2	8	856	863	75 %	0 %	25 %	0 %	387827840
10	NC_017417	CAA	3	9	883	891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827840
11	NC_017417	AAT	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
12	NC_017417	AAAGT	2	10	899	908	60 %	20 %	20 %	0 %	387827840
13	NC_017417	A	7	7	920	926	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
14	NC_017417	GAT	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
15	NC_017417	ACT	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827840
16	NC_017417	TAA	2	6	1035	1040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
17	NC_017417	AGA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
18	NC_017417	GATAA	2	10	1150	1159	60 %	20 %	20 %	0 %	387827840
19	NC_017417	AAT	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827840
20	NC_017417	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
21	NC_017417	TAG	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
22	NC_017417	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827840
23	NC_017417	ATG	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
24	NC_017417	AGA	2	6	1380	1385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827840
25	NC_017417	ATAA	2	8	1441	1448	75 %	25 %	0 %	0 %	387827840
26	NC_017417	ATG	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827840
27	NC_017417	AT	4	8	1562	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	387827840
28	NC_017417	A	6	6	1570	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	387827840
29	NC_017417	AAGTAA	2	12	1598	1609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387827840
30	NC_017417	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
31	NC_017417	TAT	2	6	1880	1885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827841
32	NC_017417	T	7	7	1909	1915	0 %	100 %	0 %	0 %	387827841
33	NC_017417	GTT	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827841
34	NC_017417	TCTA	2	8	1937	1944	25 %	50 %	0 %	25 %	387827841
35	NC_017417	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
36	NC_017417	GCATTA	2	12	1965	1976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827841
37	NC_017417	ATC	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
38	NC_017417	ACT	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
39	NC_017417	CAG	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827841
40	NC_017417	CAT	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
41	NC_017417	A	7	7	2070	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
42	NC_017417	GAT	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827841
43	NC_017417	ATA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
44	NC_017417	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
45	NC_017417	AAT	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827841
46	NC_017417	GAA	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
47	NC_017417	TAC	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827841
48	NC_017417	AGA	3	9	2312	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
49	NC_017417	AAG	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827841
50	NC_017417	TAT	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827841
51	NC_017417	AGCA	2	8	2569	2576	50 %	0 %	25 %	25 %	387827841
52	NC_017417	A	6	6	2714	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
53	NC_017417	TGCA	2	8	2750	2757	25 %	25 %	25 %	25 %	387827841
54	NC_017417	A	6	6	2808	2813	100 %	0 %	0 %	0 %	387827841
55	NC_017417	AT	3	6	2824	2829	50 %	50 %	0 %	0 %	387827841
56	NC_017417	AGAT	2	8	3099	3106	50 %	25 %	25 %	0 %	387827842
57	NC_017417	ATT	2	6	3122	3127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827842
58	NC_017417	CT	3	6	3162	3167	0 %	50 %	0 %	50 %	387827842
59	NC_017417	ACA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827842
60	NC_017417	AGC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827842
61	NC_017417	AAT	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
62	NC_017417	AAACA	2	10	3306	3315	80 %	0 %	0 %	20 %	387827842
63	NC_017417	GTT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827842
64	NC_017417	ATA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
65	NC_017417	AGC	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827842
66	NC_017417	CAA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827842
67	NC_017417	TCT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827842
68	NC_017417	AGA	2	6	3449	3454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827842
69	NC_017417	ATA	2	6	3502	3507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827842
70	NC_017417	GCTT	2	8	3514	3521	0 %	50 %	25 %	25 %	387827842
71	NC_017417	AGT	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827842
72	NC_017417	CTT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827842
73	NC_017417	ATG	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827842
74	NC_017417	TAAA	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	387827842
75	NC_017417	GCT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827842
76	NC_017417	TAC	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827843
77	NC_017417	ACA	2	6	4171	4176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827843
78	NC_017417	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
79	NC_017417	AAT	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
80	NC_017417	AAT	2	6	4236	4241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
81	NC_017417	AAG	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
82	NC_017417	A	6	6	4272	4277	100 %	0 %	0 %	0 %	387827843
83	NC_017417	AAT	2	6	4281	4286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
84	NC_017417	CAA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827843
85	NC_017417	TAA	3	9	4379	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
86	NC_017417	AGA	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
87	NC_017417	TAA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
88	NC_017417	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
89	NC_017417	AAAGT	2	10	4504	4513	60 %	20 %	20 %	0 %	387827843
90	NC_017417	T	6	6	4529	4534	0 %	100 %	0 %	0 %	387827843
91	NC_017417	AAT	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
92	NC_017417	TAA	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
93	NC_017417	TAG	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827843
94	NC_017417	ATT	2	6	4636	4641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827843
95	NC_017417	AGA	2	6	4703	4708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
96	NC_017417	AAG	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
97	NC_017417	ATA	2	6	4729	4734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827843
98	NC_017417	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827843
99	NC_017417	ATGA	2	8	4776	4783	50 %	25 %	25 %	0 %	387827843
100	NC_017417	AAG	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827843
101	NC_017417	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	387827843
102	NC_017417	GCT	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827843
103	NC_017417	AGT	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827843
104	NC_017417	ATG	2	6	7183	7188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827844
105	NC_017417	TTA	2	6	7198	7203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827844
106	NC_017417	ATA	2	6	7214	7219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827844
107	NC_017417	AGA	2	6	7263	7268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827844
108	NC_017417	A	6	6	7289	7294	100 %	0 %	0 %	0 %	387827844
109	NC_017417	AAG	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827844
110	NC_017417	A	6	6	7314	7319	100 %	0 %	0 %	0 %	387827844
111	NC_017417	AT	3	6	7324	7329	50 %	50 %	0 %	0 %	387827844
112	NC_017417	AT	3	6	7333	7338	50 %	50 %	0 %	0 %	387827844
113	NC_017417	AT	3	6	8636	8641	50 %	50 %	0 %	0 %	387827845
114	NC_017417	ATTA	2	8	8702	8709	50 %	50 %	0 %	0 %	387827845
115	NC_017417	TCTA	2	8	8715	8722	25 %	50 %	0 %	25 %	387827845
116	NC_017417	AATC	2	8	8779	8786	50 %	25 %	0 %	25 %	387827845
117	NC_017417	A	7	7	8798	8804	100 %	0 %	0 %	0 %	387827845
118	NC_017417	AATG	2	8	8849	8856	50 %	25 %	25 %	0 %	387827845
119	NC_017417	TCA	2	6	8909	8914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827845
120	NC_017417	AT	3	6	8920	8925	50 %	50 %	0 %	0 %	387827845
121	NC_017417	CAAT	2	8	8964	8971	50 %	25 %	0 %	25 %	387827845
122	NC_017417	T	7	7	9006	9012	0 %	100 %	0 %	0 %	387827845
123	NC_017417	ATA	2	6	9093	9098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827845
124	NC_017417	TTA	2	6	9121	9126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827845
125	NC_017417	ATA	2	6	9138	9143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827845
126	NC_017417	GAA	2	6	9179	9184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827845
127	NC_017417	TTA	2	6	9246	9251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827845
128	NC_017417	A	6	6	9259	9264	100 %	0 %	0 %	0 %	387827845
129	NC_017417	CCA	2	6	9421	9426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827846
130	NC_017417	TTA	2	6	9478	9483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827846
131	NC_017417	CAT	2	6	9497	9502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827846
132	NC_017417	TGC	2	6	9525	9530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827846
133	NC_017417	TAT	2	6	9533	9538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827846
134	NC_017417	CAA	2	6	9551	9556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827846
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.